More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0971 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 583 aa  1208    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  42.1 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  35.35 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  32.52 
 
 		 585 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 587 aa  296  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  31.38 
 
 		 934 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 932 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 932 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 932 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  29.75 
 
 		 951 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  30.07 
 
 		 924 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  29.22 
 
 		 893 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  29.11 
 
 		 893 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  31.3 
 
 		 934 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 946 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 912 aa  217  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  31.09 
 
 		 924 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  30.62 
 
 		 915 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  30.21 
 
 		 978 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 923 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 921 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  30.1 
 
 		 934 aa  213  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  30.18 
 
 		 908 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 943 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  30.22 
 
 		 935 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  30.09 
 
 		 926 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  30.81 
 
 		 930 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 918 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  30.24 
 
 		 933 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  30.69 
 
 		 945 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  29.59 
 
 		 924 aa  211  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  30.82 
 
 		 922 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 928 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  30.51 
 
 		 915 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 923 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  30.82 
 
 		 922 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  28.75 
 
 		 930 aa  210  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  29.35 
 
 		 923 aa  210  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 922 aa  210  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  30.41 
 
 		 968 aa  209  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  29.17 
 
 		 931 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  30.11 
 
 		 931 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  30.33 
 
 		 892 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 944 aa  209  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  30.58 
 
 		 935 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  28.44 
 
 		 1013 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  30.58 
 
 		 921 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  30.58 
 
 		 921 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 922 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  30.41 
 
 		 915 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  30.58 
 
 		 921 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  28.64 
 
 		 896 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  30.24 
 
 		 922 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  30.25 
 
 		 913 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  31.21 
 
 		 899 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  30.4 
 
 		 902 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  31.21 
 
 		 899 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 917 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  31.39 
 
 		 933 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  29.73 
 
 		 929 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  29.21 
 
 		 979 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  30.81 
 
 		 918 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  29.75 
 
 		 929 aa  203  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  29.21 
 
 		 978 aa  203  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  30.37 
 
 		 902 aa  203  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 982 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  28.83 
 
 		 950 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  28.73 
 
 		 992 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  29.92 
 
 		 939 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  29.81 
 
 		 903 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 928 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  29.7 
 
 		 915 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  29.79 
 
 		 941 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  29.35 
 
 		 906 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  29.61 
 
 		 896 aa  200  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  29.01 
 
 		 957 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  28.93 
 
 		 936 aa  200  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  29.3 
 
 		 943 aa  200  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  30.14 
 
 		 928 aa  200  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 935 aa  200  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  30.64 
 
 		 915 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  28.97 
 
 		 976 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  30.38 
 
 		 953 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  28.46 
 
 		 928 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 908 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 929 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  29.16 
 
 		 905 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 907 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  28.66 
 
 		 942 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  29.64 
 
 		 945 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 928 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  29.76 
 
 		 870 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>