More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0542 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 585 aa  1185    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  42.88 
 
 		 587 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  32.52 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 		 682 aa  273  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  31.17 
 
 		 879 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 879 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  30.81 
 
 		 896 aa  202  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  33.49 
 
 		 994 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 936 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  29.8 
 
 		 928 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 879 aa  198  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  29.45 
 
 		 931 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 924 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  30.46 
 
 		 893 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  30.11 
 
 		 893 aa  194  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  28.31 
 
 		 912 aa  194  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  29.12 
 
 		 917 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  27.81 
 
 		 915 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  28.02 
 
 		 915 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  30.47 
 
 		 879 aa  193  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  28.33 
 
 		 951 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 879 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 913 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 915 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  28.48 
 
 		 915 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  27.99 
 
 		 931 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  28.83 
 
 		 934 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  27.39 
 
 		 953 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  27.96 
 
 		 928 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  29.37 
 
 		 924 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  28.94 
 
 		 929 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  29.73 
 
 		 936 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  28.84 
 
 		 926 aa  187  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  29.85 
 
 		 924 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  29.2 
 
 		 929 aa  187  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  32.04 
 
 		 929 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  27.91 
 
 		 946 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  27.71 
 
 		 885 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  29.31 
 
 		 945 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  32.18 
 
 		 873 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  31.57 
 
 		 883 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 932 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  27.09 
 
 		 904 aa  185  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 908 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  29.07 
 
 		 892 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  28.03 
 
 		 928 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  27.35 
 
 		 891 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  28.41 
 
 		 922 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  27.84 
 
 		 933 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  27.51 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  27.51 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  27.51 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 928 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  28.12 
 
 		 928 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 875 aa  181  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  29.39 
 
 		 926 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  28.69 
 
 		 875 aa  181  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 928 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 928 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 928 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  27.35 
 
 		 935 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  27.32 
 
 		 903 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 928 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  28.73 
 
 		 922 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  28.78 
 
 		 945 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 922 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  28.28 
 
 		 930 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  29.32 
 
 		 922 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  25.81 
 
 		 906 aa  179  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  28.39 
 
 		 918 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  28.14 
 
 		 923 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  27.17 
 
 		 956 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  26.51 
 
 		 968 aa  178  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 888 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  29.4 
 
 		 923 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  29.04 
 
 		 922 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  28.7 
 
 		 916 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  29.4 
 
 		 923 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  26.73 
 
 		 935 aa  177  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 939 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  28.92 
 
 		 934 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  28.16 
 
 		 892 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  32.06 
 
 		 872 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  28.9 
 
 		 950 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  28.62 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  27.31 
 
 		 911 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  27.55 
 
 		 1022 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  28.55 
 
 		 938 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>