More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0601 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 587 aa  1187    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  42.88 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  33.93 
 
 		 583 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 682 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  31.61 
 
 		 582 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  30.16 
 
 		 951 aa  226  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 912 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  31.57 
 
 		 896 aa  220  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 916 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  30.97 
 
 		 926 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  31.26 
 
 		 911 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  29.81 
 
 		 908 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  29.01 
 
 		 928 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  30.33 
 
 		 903 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  29.25 
 
 		 896 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 936 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  29.69 
 
 		 931 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  29.54 
 
 		 942 aa  200  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  30.4 
 
 		 939 aa  200  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  28.93 
 
 		 906 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  29.27 
 
 		 915 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 890 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  29.7 
 
 		 930 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  28.72 
 
 		 915 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  29.74 
 
 		 924 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  29.54 
 
 		 905 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  29.01 
 
 		 915 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  29.95 
 
 		 898 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  28.65 
 
 		 924 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  28.15 
 
 		 913 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  29.39 
 
 		 935 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  27.92 
 
 		 917 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 939 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  30.69 
 
 		 893 aa  196  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  29.86 
 
 		 923 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  29.83 
 
 		 934 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  28.62 
 
 		 896 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  28.36 
 
 		 904 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  28.88 
 
 		 941 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  30.51 
 
 		 893 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 930 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  30.35 
 
 		 938 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  29.01 
 
 		 903 aa  194  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  29.62 
 
 		 933 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  30.55 
 
 		 918 aa  193  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  29.94 
 
 		 929 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  28.73 
 
 		 926 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  30.42 
 
 		 892 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 939 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  28.86 
 
 		 908 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  29.76 
 
 		 929 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  30.02 
 
 		 943 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  29.64 
 
 		 910 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  29.42 
 
 		 921 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  29.4 
 
 		 1022 aa  190  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 928 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 928 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  29.47 
 
 		 956 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  28.39 
 
 		 915 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  29.78 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  30.04 
 
 		 879 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  28.03 
 
 		 934 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  29.83 
 
 		 988 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  28.89 
 
 		 902 aa  189  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  28.89 
 
 		 902 aa  189  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  30.99 
 
 		 933 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  30.42 
 
 		 922 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  29.25 
 
 		 921 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  29.25 
 
 		 921 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  29.25 
 
 		 935 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  30.91 
 
 		 949 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  30.97 
 
 		 1024 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  31.43 
 
 		 879 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  30.9 
 
 		 908 aa  187  4e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  29.13 
 
 		 936 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  29.03 
 
 		 924 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  30.13 
 
 		 922 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 922 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  29.7 
 
 		 922 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  29.14 
 
 		 928 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  29.49 
 
 		 932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  29.49 
 
 		 932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  29.6 
 
 		 921 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  29.49 
 
 		 932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  29.62 
 
 		 956 aa  184  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  29.98 
 
 		 922 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  29.27 
 
 		 937 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  29.69 
 
 		 932 aa  184  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>