More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2856 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  71.83 
 
 		 646 aa  999    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  68.28 
 
 		 662 aa  966    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  94.88 
 
 		 644 aa  1287    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 647 aa  1349    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  67.49 
 
 		 644 aa  919    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  53.81 
 
 		 652 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  58.51 
 
 		 644 aa  808    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  53.78 
 
 		 650 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  49.16 
 
 		 653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  49.16 
 
 		 653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  30.13 
 
 		 693 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  30.34 
 
 		 726 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  30.34 
 
 		 726 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  30.75 
 
 		 726 aa  264  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 704 aa  263  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  30.1 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  31.08 
 
 		 422 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  29.58 
 
 		 361 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 154 aa  94.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  26.52 
 
 		 879 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  26.95 
 
 		 924 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 930 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  25.75 
 
 		 886 aa  74.7  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  25.06 
 
 		 953 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  23.93 
 
 		 946 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  25.45 
 
 		 855 aa  73.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  27.59 
 
 		 878 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  25.97 
 
 		 872 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  24.68 
 
 		 912 aa  72  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 929 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  27.13 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  23.36 
 
 		 934 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  25.74 
 
 		 931 aa  70.5  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  23.88 
 
 		 922 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  26.36 
 
 		 861 aa  70.5  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  25.45 
 
 		 930 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  25.18 
 
 		 896 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  22.96 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  23.59 
 
 		 933 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  24.3 
 
 		 896 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  23.94 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  24.83 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  24.81 
 
 		 1047 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 943 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  24.23 
 
 		 912 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  30.09 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  23.89 
 
 		 945 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 930 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  29.09 
 
 		 939 aa  68.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  31.09 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  27.42 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  23.78 
 
 		 918 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  25.5 
 
 		 947 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  27.95 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  25.82 
 
 		 913 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  28.37 
 
 		 1043 aa  67.4  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  26.14 
 
 		 951 aa  67.4  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  24.72 
 
 		 883 aa  67.4  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  23.71 
 
 		 918 aa  67  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  30 
 
 		 1004 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  33.05 
 
 		 942 aa  67  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  33.09 
 
 		 924 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 908 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  23.12 
 
 		 928 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  27.24 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 1024 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  27.59 
 
 		 936 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  33.6 
 
 		 1010 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  25.19 
 
 		 929 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 926 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  25.96 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  28.34 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  28.34 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  23.44 
 
 		 976 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  23.95 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  28.15 
 
 		 885 aa  65.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  24.9 
 
 		 929 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 978 aa  65.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  23.95 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  23.21 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  23.95 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 911 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  30.05 
 
 		 915 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  25.59 
 
 		 893 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  25.59 
 
 		 893 aa  65.1  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 1016 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.12 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  33.6 
 
 		 1014 aa  64.7  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  32.31 
 
 		 1047 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  32.31 
 
 		 1047 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 979 aa  64.3  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 978 aa  64.3  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 976 aa  63.9  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  23.99 
 
 		 921 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>