More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4423 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  750    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  750    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 930 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 921 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 915 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  60.37 
 
 		 1025 aa  1161    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 937 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  54.83 
 
 		 1016 aa  1026    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  54.95 
 
 		 1060 aa  1070    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  58.36 
 
 		 1020 aa  1095    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 946 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  55.78 
 
 		 1047 aa  1052    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 936 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  63.96 
 
 		 968 aa  1300    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  55.59 
 
 		 1047 aa  1045    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  74.83 
 
 		 979 aa  1527    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  54.35 
 
 		 932 aa  1024    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 947 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 921 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  60.26 
 
 		 979 aa  1164    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  55.31 
 
 		 937 aa  1045    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 915 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.56 
 
 		 918 aa  670    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  43.06 
 
 		 934 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 956 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 942 aa  710    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  75.38 
 
 		 976 aa  1541    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 941 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  750    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  41.3 
 
 		 907 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  60.34 
 
 		 1010 aa  1163    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 930 aa  716    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  44.46 
 
 		 928 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 935 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  54.61 
 
 		 937 aa  1036    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.56 
 
 		 933 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 917 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  43.96 
 
 		 928 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 916 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 923 aa  659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 932 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 935 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.46 
 
 		 923 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  42.23 
 
 		 939 aa  753    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 932 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  76.34 
 
 		 1004 aa  1569    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  56.88 
 
 		 973 aa  1055    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  59.69 
 
 		 1000 aa  1175    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 905 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  51.29 
 
 		 924 aa  877    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 922 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 936 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  59.49 
 
 		 1032 aa  1155    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  49.36 
 
 		 945 aa  870    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  44.16 
 
 		 928 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  53.71 
 
 		 929 aa  986    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 957 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 945 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  59.75 
 
 		 1021 aa  1169    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 910 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 944 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 913 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 921 aa  705    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  60.22 
 
 		 1033 aa  1173    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 928 aa  694    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  60.7 
 
 		 1014 aa  1148    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 988 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  750    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 927 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  56.53 
 
 		 935 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  49.4 
 
 		 937 aa  875    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  41.12 
 
 		 917 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  43.23 
 
 		 933 aa  719    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 928 aa  717    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  71.4 
 
 		 978 aa  1454    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  42.17 
 
 		 924 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 941 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 922 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 951 aa  713    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  49.7 
 
 		 941 aa  922    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  41.86 
 
 		 922 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 922 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  41.96 
 
 		 918 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 934 aa  709    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  56.49 
 
 		 928 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 917 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 923 aa  657    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 928 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  54.41 
 
 		 937 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  42.14 
 
 		 943 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  43.96 
 
 		 928 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  41.12 
 
 		 917 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  41.12 
 
 		 917 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  74.97 
 
 		 978 aa  1531    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 911 aa  746    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  42.36 
 
 		 922 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 932 aa  726    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  56.76 
 
 		 1043 aa  1085    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  41.06 
 
 		 934 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>