More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1080 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  100 
 
 		 886 aa  1739    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 893 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 883 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 906 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 872 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 909 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 908 aa  562  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 904 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 901 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 878 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 878 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 920 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 920 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 877 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 891 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 879 aa  544  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 876 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 876 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.28 
 
 		 866 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 899 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 866 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 929 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36 
 
 		 876 aa  535  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 868 aa  535  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 899 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.26 
 
 		 850 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 911 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 889 aa  532  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 928 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.88 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  40.87 
 
 		 910 aa  529  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 877 aa  527  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 908 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 873 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  40.22 
 
 		 901 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 875 aa  522  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 902 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 885 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 955 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 917 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 912 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 893 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 892 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  40.44 
 
 		 888 aa  515  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 894 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 870 aa  512  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 884 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 892 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 843 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 866 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  36.68 
 
 		 879 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 891 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 901 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 892 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 905 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 880 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 929 aa  502  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 893 aa  501  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 893 aa  502  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  32.77 
 
 		 855 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 890 aa  497  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 949 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 902 aa  495  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 940 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 903 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 888 aa  488  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 926 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 951 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 930 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 946 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 892 aa  485  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 932 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 932 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 903 aa  485  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 932 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  35.85 
 
 		 924 aa  482  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 939 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 928 aa  482  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 888 aa  482  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 903 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 931 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 955 aa  479  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  34.22 
 
 		 926 aa  473  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 906 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.82 
 
 		 930 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  34.79 
 
 		 903 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 943 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 872 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 950 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 892 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  32.91 
 
 		 916 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  34.83 
 
 		 903 aa  469  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 885 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 902 aa  468  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  34.81 
 
 		 903 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 953 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  34.7 
 
 		 929 aa  469  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  34.49 
 
 		 918 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 902 aa  468  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>