More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0738 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 905 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  44.7 
 
 		 908 aa  702    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  58.49 
 
 		 1025 aa  1142    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 908 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  43.47 
 
 		 937 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  46.83 
 
 		 928 aa  762    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  46.49 
 
 		 910 aa  754    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  44.71 
 
 		 899 aa  708    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  45.88 
 
 		 929 aa  752    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  45.45 
 
 		 901 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  100 
 
 		 955 aa  1970    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  45.41 
 
 		 904 aa  713    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  45.17 
 
 		 908 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  43.41 
 
 		 945 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  43.78 
 
 		 917 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  43.35 
 
 		 929 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 949 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  45.9 
 
 		 894 aa  733    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  43.55 
 
 		 920 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  45.23 
 
 		 906 aa  720    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  44.36 
 
 		 893 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  44.72 
 
 		 904 aa  716    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  44.42 
 
 		 955 aa  740    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 901 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  43.92 
 
 		 910 aa  688    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 911 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  44.97 
 
 		 893 aa  735    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  45.87 
 
 		 889 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  42.18 
 
 		 912 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  43.55 
 
 		 920 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  44.53 
 
 		 888 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  44.52 
 
 		 933 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  43.14 
 
 		 905 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  44.19 
 
 		 899 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 939 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 956 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 870 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  36.15 
 
 		 885 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 924 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 912 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.75 
 
 		 903 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 946 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34 
 
 		 883 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 949 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 885 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 866 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  33.37 
 
 		 866 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  34.28 
 
 		 903 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 963 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.87 
 
 		 891 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 932 aa  502  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  32.35 
 
 		 879 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  32.99 
 
 		 939 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 911 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33.06 
 
 		 888 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 934 aa  492  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 912 aa  492  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  32.88 
 
 		 926 aa  486  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  32.51 
 
 		 939 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 888 aa  485  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 902 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 902 aa  485  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 930 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  32.46 
 
 		 872 aa  482  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 877 aa  480  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  32.75 
 
 		 943 aa  479  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 929 aa  479  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 892 aa  479  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 		 933 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 879 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  33.93 
 
 		 906 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  32.63 
 
 		 896 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 940 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  33.37 
 
 		 880 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 896 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 896 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 929 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  33.82 
 
 		 934 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 942 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 932 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  33.47 
 
 		 932 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 932 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  33.54 
 
 		 908 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  33.64 
 
 		 930 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 891 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 944 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  32.53 
 
 		 913 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 873 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 915 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  31.89 
 
 		 928 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  33.26 
 
 		 907 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  31.06 
 
 		 926 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 916 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 897 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 926 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  32.88 
 
 		 913 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 893 aa  462  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 928 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>