More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1873 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 755 aa  1561    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  32.99 
 
 		 896 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  32.85 
 
 		 896 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 899 aa  317  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 899 aa  317  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 906 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  32.98 
 
 		 933 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 891 aa  313  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 905 aa  310  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  33.28 
 
 		 923 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.9 
 
 		 892 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  33.13 
 
 		 924 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 916 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 940 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  31.41 
 
 		 915 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  33.18 
 
 		 893 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  31.96 
 
 		 915 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  31.13 
 
 		 915 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 922 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 922 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  31.13 
 
 		 915 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  33.03 
 
 		 893 aa  303  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  32.14 
 
 		 913 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 937 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  33.18 
 
 		 937 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 891 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  33.69 
 
 		 906 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.64 
 
 		 903 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 932 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  31.72 
 
 		 917 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 922 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 932 aa  298  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 932 aa  298  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  33.28 
 
 		 922 aa  297  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  33.02 
 
 		 933 aa  297  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 934 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 931 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  32.2 
 
 		 903 aa  296  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  32.87 
 
 		 908 aa  296  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  32.4 
 
 		 908 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 930 aa  296  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  31.95 
 
 		 921 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 922 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 921 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 911 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 892 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 931 aa  294  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 934 aa  294  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 951 aa  294  5e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 923 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  32.87 
 
 		 926 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  33.03 
 
 		 946 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 926 aa  293  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 926 aa  293  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 926 aa  293  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 926 aa  293  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  32.77 
 
 		 928 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  32.62 
 
 		 928 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  32.25 
 
 		 921 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 904 aa  292  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 934 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  32.25 
 
 		 935 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 923 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 923 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 918 aa  291  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  31.32 
 
 		 938 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  32.46 
 
 		 930 aa  287  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 921 aa  287  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 928 aa  286  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  32.33 
 
 		 941 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  30.79 
 
 		 965 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 926 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 929 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 945 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 972 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 892 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  32.25 
 
 		 915 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  32.62 
 
 		 929 aa  283  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 935 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  32.31 
 
 		 930 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 939 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  32.53 
 
 		 911 aa  281  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  32.41 
 
 		 910 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  31.26 
 
 		 937 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  33.13 
 
 		 976 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 986 aa  280  7e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  31.57 
 
 		 890 aa  279  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  31.11 
 
 		 937 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  32.31 
 
 		 915 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  32.77 
 
 		 918 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  32.39 
 
 		 947 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 892 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 898 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 946 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 888 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  30.65 
 
 		 912 aa  278  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 893 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  33.28 
 
 		 922 aa  277  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  33.23 
 
 		 976 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  31.79 
 
 		 982 aa  276  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>