189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00793 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 361 aa  758    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 		 647 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  29.23 
 
 		 644 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  29.25 
 
 		 646 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  27.84 
 
 		 662 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  27.76 
 
 		 653 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  27.76 
 
 		 653 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  27.62 
 
 		 652 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  24.88 
 
 		 693 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  27.95 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  26.35 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  26.35 
 
 		 644 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  26.74 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 937 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 928 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 931 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  24.82 
 
 		 929 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  24.37 
 
 		 879 aa  69.7  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  24.04 
 
 		 956 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  24.51 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  24.63 
 
 		 929 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  27.18 
 
 		 939 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 907 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 927 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  24.86 
 
 		 726 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  24.86 
 
 		 726 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  26.67 
 
 		 957 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 922 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  25.17 
 
 		 926 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 922 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  23.69 
 
 		 988 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  24.44 
 
 		 1045 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.25 
 
 		 934 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 936 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  22.07 
 
 		 850 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 923 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  25.96 
 
 		 953 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  26.25 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  24.15 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  28.8 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 923 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  26.2 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 902 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 941 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  23.86 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  25.24 
 
 		 966 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  26.2 
 
 		 879 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 928 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  29.53 
 
 		 956 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 921 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  25.17 
 
 		 1014 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  26.47 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 908 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  24.52 
 
 		 1000 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  25.57 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  34.19 
 
 		 924 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  32.76 
 
 		 935 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  25.49 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 925 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  25.49 
 
 		 726 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  25.21 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 939 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  24.83 
 
 		 1010 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  33.61 
 
 		 930 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  24.81 
 
 		 979 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  24.32 
 
 		 1021 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  25.82 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  25.28 
 
 		 972 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  25.28 
 
 		 972 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  24.81 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  23.71 
 
 		 965 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  24.14 
 
 		 930 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  31.33 
 
 		 924 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  32.5 
 
 		 933 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  25 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  25.62 
 
 		 899 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  23 
 
 		 879 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  23 
 
 		 1022 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  31.67 
 
 		 1047 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  31.54 
 
 		 940 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 953 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 943 aa  60.1  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  34.58 
 
 		 1043 aa  59.7  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 1025 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  34.55 
 
 		 936 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  30.06 
 
 		 896 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  25.69 
 
 		 1033 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  24.32 
 
 		 929 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  26.2 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  24.44 
 
 		 976 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  24.73 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  31.67 
 
 		 1047 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  30.46 
 
 		 912 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  25.08 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>