More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0074 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  100 
 
 		 646 aa  1348    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  75.38 
 
 		 662 aa  1065    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  56.95 
 
 		 652 aa  719    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  55.2 
 
 		 650 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  72.14 
 
 		 644 aa  1003    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  65.43 
 
 		 644 aa  885    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  71.83 
 
 		 647 aa  999    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  58.95 
 
 		 644 aa  804    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  49.77 
 
 		 653 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  49.77 
 
 		 653 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  31.42 
 
 		 693 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 726 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 726 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  30.98 
 
 		 726 aa  276  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 704 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  31.02 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  30.73 
 
 		 422 aa  143  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 377 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  29.25 
 
 		 361 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  37.66 
 
 		 154 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  25.45 
 
 		 879 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  25.15 
 
 		 929 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  27.13 
 
 		 912 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 930 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  24.62 
 
 		 866 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  24.62 
 
 		 866 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  25.2 
 
 		 939 aa  75.1  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  24.29 
 
 		 924 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  26.86 
 
 		 878 aa  74.3  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  26.49 
 
 		 915 aa  73.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  26.53 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  27.76 
 
 		 1016 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  25.8 
 
 		 896 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  25.72 
 
 		 918 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  24.94 
 
 		 846 aa  72  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  28.16 
 
 		 903 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 928 aa  70.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  27.76 
 
 		 978 aa  70.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  25.09 
 
 		 896 aa  70.5  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  26.94 
 
 		 1004 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  25 
 
 		 934 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  27.57 
 
 		 979 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  26.12 
 
 		 1024 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  27.87 
 
 		 917 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 1047 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  25.93 
 
 		 911 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  23.52 
 
 		 946 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  27.87 
 
 		 913 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  23.62 
 
 		 886 aa  68.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  25.93 
 
 		 968 aa  67.8  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  26.75 
 
 		 976 aa  68.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  25.17 
 
 		 906 aa  67.8  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  24 
 
 		 1043 aa  67.8  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  26.15 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  27.16 
 
 		 979 aa  67.8  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 891 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  27.16 
 
 		 978 aa  67.8  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  24.36 
 
 		 922 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  25.82 
 
 		 930 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  25.71 
 
 		 929 aa  67  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  27.57 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  25.45 
 
 		 922 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  28.28 
 
 		 947 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 928 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  25.19 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  25.82 
 
 		 938 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 941 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 944 aa  65.9  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  25.41 
 
 		 908 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  24.28 
 
 		 926 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  24 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  24 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  24 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  23.48 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  24 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  24.59 
 
 		 928 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  23.58 
 
 		 945 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  31.71 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  24.94 
 
 		 936 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  25.81 
 
 		 1000 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  32.39 
 
 		 999 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  23.27 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 1060 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  27.53 
 
 		 872 aa  64.7  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 1013 aa  64.7  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  23.74 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  22.78 
 
 		 876 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  33.86 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  24.21 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  22.15 
 
 		 908 aa  63.9  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  23.35 
 
 		 986 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 917 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  26.17 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>