More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3062 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  56.95 
 
 		 646 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  55.14 
 
 		 662 aa  717    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  52.2 
 
 		 653 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  53.23 
 
 		 644 aa  686    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  58 
 
 		 644 aa  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 652 aa  1351    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  65.9 
 
 		 650 aa  872    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  53.53 
 
 		 644 aa  707    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  52.2 
 
 		 653 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  53.81 
 
 		 647 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  33.06 
 
 		 693 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  32.24 
 
 		 726 aa  320  5e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  32.06 
 
 		 726 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  32.06 
 
 		 726 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  30.78 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  31.77 
 
 		 567 aa  249  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  30.9 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 377 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  44.2 
 
 		 154 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  27.62 
 
 		 361 aa  87.8  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  25.95 
 
 		 939 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 930 aa  71.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  23.09 
 
 		 953 aa  70.5  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  25 
 
 		 953 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  25.89 
 
 		 879 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  23.69 
 
 		 893 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  23.69 
 
 		 893 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 879 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  24.6 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  25.97 
 
 		 911 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  25.79 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  24.15 
 
 		 929 aa  67.4  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  23.62 
 
 		 943 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 899 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  24.91 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  23.19 
 
 		 908 aa  65.5  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  25.36 
 
 		 932 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  22.83 
 
 		 942 aa  65.1  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  23.61 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  20.84 
 
 		 994 aa  64.7  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  24.92 
 
 		 880 aa  64.7  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 915 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  27.13 
 
 		 935 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  23.36 
 
 		 903 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 915 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  24.72 
 
 		 946 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  21.43 
 
 		 866 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  25.98 
 
 		 903 aa  63.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  25.71 
 
 		 979 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  25.86 
 
 		 979 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  26.24 
 
 		 890 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  26.02 
 
 		 915 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  23.36 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  23.36 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  24.34 
 
 		 877 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  25.71 
 
 		 978 aa  62.4  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  23.11 
 
 		 956 aa  62  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  26.22 
 
 		 999 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  22.7 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  23.83 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  22.48 
 
 		 888 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  24.5 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  22.87 
 
 		 939 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  26.17 
 
 		 899 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  24.01 
 
 		 938 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  26.36 
 
 		 1010 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  24.6 
 
 		 976 aa  60.8  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 866 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  25.95 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  30.89 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 866 aa  60.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  25.99 
 
 		 912 aa  60.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  24.82 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  23.02 
 
 		 903 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 891 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  23.42 
 
 		 896 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  25.28 
 
 		 1016 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  25.81 
 
 		 917 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 1020 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  24.64 
 
 		 898 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  26.07 
 
 		 945 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  24.11 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  23.97 
 
 		 907 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  23.82 
 
 		 911 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  25.62 
 
 		 896 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  24.71 
 
 		 917 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  22.78 
 
 		 1013 aa  59.7  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 877 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  24.38 
 
 		 886 aa  59.7  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 891 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  24.24 
 
 		 1024 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  25.76 
 
 		 1014 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  23.11 
 
 		 878 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  25.09 
 
 		 928 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  24.35 
 
 		 1024 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>