More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1100 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  55.14 
 
 		 652 aa  717    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  75.38 
 
 		 646 aa  1065    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  100 
 
 		 662 aa  1384    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  68.73 
 
 		 644 aa  967    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  68.28 
 
 		 647 aa  966    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  53.35 
 
 		 650 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  56.48 
 
 		 644 aa  782    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  62.2 
 
 		 644 aa  862    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  48.59 
 
 		 653 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  48.59 
 
 		 653 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 		 693 aa  293  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  30.35 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  30.35 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  30.21 
 
 		 726 aa  262  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 		 704 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  30.37 
 
 		 567 aa  205  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  31.71 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 		 377 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  27.84 
 
 		 361 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  37.01 
 
 		 154 aa  90.9  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  22.53 
 
 		 879 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 939 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  26.74 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  23.44 
 
 		 911 aa  71.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  22.97 
 
 		 866 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  23.21 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  23.02 
 
 		 923 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  23.58 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  23.58 
 
 		 896 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  23.59 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  22.3 
 
 		 985 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  24.93 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.53 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  31.97 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  28.16 
 
 		 978 aa  68.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  25.41 
 
 		 912 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  34.31 
 
 		 924 aa  67.4  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  22.8 
 
 		 929 aa  67.4  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  24.63 
 
 		 1047 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  27.76 
 
 		 1013 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 999 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 891 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  42.53 
 
 		 979 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 878 aa  66.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 1010 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  22.72 
 
 		 953 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  26.97 
 
 		 1060 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  42.53 
 
 		 976 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  42.53 
 
 		 978 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 979 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  24.56 
 
 		 903 aa  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 1004 aa  65.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  24.69 
 
 		 935 aa  65.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  25.27 
 
 		 1024 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  24.59 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  28.37 
 
 		 943 aa  65.1  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  25.93 
 
 		 861 aa  65.1  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  23.26 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  25.56 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  23.14 
 
 		 926 aa  64.3  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  23.29 
 
 		 930 aa  64.3  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  26.14 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  22.59 
 
 		 973 aa  63.9  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  28.37 
 
 		 942 aa  63.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 1047 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 992 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  25 
 
 		 932 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  26.23 
 
 		 1014 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  30.99 
 
 		 936 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 1016 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 1047 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  24.59 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  23.25 
 
 		 922 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  25.41 
 
 		 1043 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  24.35 
 
 		 896 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  24.5 
 
 		 915 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  21.34 
 
 		 875 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  25.41 
 
 		 934 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  25.82 
 
 		 1033 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  24.09 
 
 		 928 aa  62.4  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 875 aa  62.4  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  24.18 
 
 		 866 aa  62.4  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  22.35 
 
 		 956 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  25.81 
 
 		 1000 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  25.5 
 
 		 886 aa  62  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  22.62 
 
 		 930 aa  61.6  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  24.18 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  23.55 
 
 		 922 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  25 
 
 		 893 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  25 
 
 		 1032 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  25.41 
 
 		 1021 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  23.65 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  25 
 
 		 1025 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 905 aa  61.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  23.65 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  31.91 
 
 		 940 aa  61.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  25 
 
 		 1020 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  24.22 
 
 		 885 aa  60.5  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>