53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0424 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  94.78 
 
 		 726 aa  723    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  94.78 
 
 		 726 aa  723    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 567 aa  829    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 726 aa  827    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 422 aa  869    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 693 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  94.74 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  96.1 
 
 		 154 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 704 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  31.87 
 
 		 652 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  32.31 
 
 		 650 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  32.71 
 
 		 653 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  32.71 
 
 		 653 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  31.55 
 
 		 644 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  32.93 
 
 		 644 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  31.95 
 
 		 662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  31.46 
 
 		 646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  31.81 
 
 		 647 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 644 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  26.33 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 897 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 897 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  27.73 
 
 		 913 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  25.9 
 
 		 897 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 908 aa  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  27.56 
 
 		 913 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  27.73 
 
 		 915 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  27.73 
 
 		 926 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 923 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 926 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 926 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 923 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 923 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 926 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 926 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  24.48 
 
 		 922 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 939 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 922 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 946 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  25.35 
 
 		 906 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 836 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  26.57 
 
 		 931 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 903 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 921 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>