52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1407 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  96.17 
 
 		 726 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 377 aa  776    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  96.17 
 
 		 726 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  94.35 
 
 		 726 aa  647    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  92.1 
 
 		 567 aa  650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  55.96 
 
 		 693 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  91.88 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  41.48 
 
 		 704 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 644 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 652 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  30 
 
 		 644 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 653 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 653 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  30.4 
 
 		 647 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  30.68 
 
 		 646 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  29.83 
 
 		 644 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  29.41 
 
 		 662 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  24.1 
 
 		 897 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  24.1 
 
 		 897 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  23.69 
 
 		 897 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  20.63 
 
 		 915 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 913 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  27.74 
 
 		 908 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  26.77 
 
 		 582 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  22.33 
 
 		 926 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  26.77 
 
 		 913 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 926 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 923 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 926 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 926 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 926 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 923 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  22.22 
 
 		 923 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  23.29 
 
 		 899 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 918 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 939 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 922 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 836 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 903 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 921 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 935 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 921 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 917 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  25.35 
 
 		 922 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  25.35 
 
 		 922 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 921 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>