More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2285 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  69.44 
 
 		 846 aa  919    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  100 
 
 		 1273 aa  2599    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 870 aa  458  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 893 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 893 aa  446  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 866 aa  433  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 908 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 878 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 868 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 877 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 877 aa  422  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 877 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 877 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 891 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 891 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 891 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 877 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 877 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 850 aa  423  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 877 aa  420  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 877 aa  416  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.87 
 
 		 924 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.52 
 
 		 892 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 884 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 876 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 876 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.43 
 
 		 892 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 892 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  35.99 
 
 		 876 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 878 aa  403  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.38 
 
 		 896 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 876 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 893 aa  403  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 891 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 898 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  37.62 
 
 		 895 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  37.96 
 
 		 873 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 872 aa  399  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  36.46 
 
 		 892 aa  396  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.3 
 
 		 879 aa  393  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 892 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 931 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 936 aa  390  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 888 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 911 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 943 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 877 aa  387  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 855 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 907 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 903 aa  376  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 897 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 897 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 945 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 932 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  34.97 
 
 		 899 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 885 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 872 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 906 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  35 
 
 		 897 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 866 aa  373  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 866 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 880 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 		 923 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 879 aa  370  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  35.36 
 
 		 922 aa  364  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 928 aa  360  8e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 903 aa  358  3.9999999999999996e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 893 aa  357  6.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 845 aa  356  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 890 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  34.42 
 
 		 929 aa  353  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 861 aa  345  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 885 aa  341  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 862 aa  340  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 941 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  33.29 
 
 		 885 aa  332  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 875 aa  330  8e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 858 aa  330  1.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  33.03 
 
 		 949 aa  327  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  56.35 
 
 		 907 aa  323  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 836 aa  320  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 879 aa  319  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 829 aa  316  1.9999999999999998e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  32.77 
 
 		 945 aa  310  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  30.38 
 
 		 911 aa  309  3e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  32.04 
 
 		 879 aa  308  4.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  31.86 
 
 		 879 aa  302  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  31.59 
 
 		 879 aa  303  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 879 aa  302  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  54.92 
 
 		 936 aa  258  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  50.19 
 
 		 933 aa  254  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  42.61 
 
 		 921 aa  249  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0390  DNA polymerase I  48.68 
 
 		 923 aa  248  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  51.75 
 
 		 928 aa  247  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  51.31 
 
 		 912 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  48.68 
 
 		 923 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  47.57 
 
 		 972 aa  246  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  48.75 
 
 		 903 aa  244  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  45 
 
 		 930 aa  244  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>