More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1172 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  487  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  56.68 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  54.73 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  54.96 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  52.63 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  54.96 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  55.38 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 261 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.91 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  55.1 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  51.44 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  47.41 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  47.52 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  48.76 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  44.92 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  45.85 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 687 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  39.13 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  44.13 
 
 		 266 aa  179  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  44.13 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  48.33 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.84 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  40.56 
 
 		 252 aa  177  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  41.09 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>