More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1779 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  78.4 
 
 		 252 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  74.6 
 
 		 250 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  68.67 
 
 		 252 aa  357  8e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  70.28 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  70.56 
 
 		 251 aa  351  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  65.06 
 
 		 250 aa  342  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 251 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  53.44 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 252 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  244  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 654 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  48.55 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.61 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  46.26 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 646 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 655 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 650 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  45.91 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  46.9 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>