More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0908 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  69.08 
 
 		 252 aa  359  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  67.34 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  65.06 
 
 		 251 aa  342  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  67.87 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  65.06 
 
 		 249 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  62.1 
 
 		 251 aa  324  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  54.18 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  52.61 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.61 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 650 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 654 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  49.34 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 655 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49 
 
 		 646 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  48.63 
 
 		 249 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.02 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.58 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 298 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  46.83 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>