More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3813 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  92.49 
 
 		 254 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  69.88 
 
 		 250 aa  361  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 		 250 aa  325  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  54.22 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  57.03 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  53.63 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.32 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  55.02 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 654 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 248 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 248 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  52.72 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  53.14 
 
 		 243 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  55.87 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 655 aa  258  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.67 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 298 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 257 aa  244  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  52.36 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  52.53 
 
 		 265 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.57 
 
 		 687 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  48.97 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  51.97 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 650 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 263 aa  234  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  51.98 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  48.57 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>