More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0241 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 243 aa  490  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  95.88 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  68.18 
 
 		 243 aa  350  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  65.7 
 
 		 655 aa  341  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  63.22 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  54.85 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  53.56 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  53.59 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  52.72 
 
 		 254 aa  262  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  56.54 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  53.33 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  55.74 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  56.77 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  54.47 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  54.01 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56.83 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  54.82 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.77 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  53.95 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  51.88 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  54.32 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  51.9 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  55.32 
 
 		 255 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  52.32 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  52.72 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  53.88 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  54.19 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  54.19 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  52.74 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.36 
 
 		 654 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.56 
 
 		 650 aa  248  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  52.32 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  51.06 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  50.63 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  53.19 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  52.52 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  51.08 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.81 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  52.1 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.26 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  48.7 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  52.32 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.63 
 
 		 646 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48.75 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  51.95 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 253 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  48.76 
 
 		 256 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  49.36 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  51.52 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  48.51 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.54 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  48.33 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  49.36 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  51.8 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  47.68 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  48.95 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  48.1 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  48.33 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  48.56 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  51.05 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  45.96 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  52.45 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  50.46 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.92 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46.93 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  51.53 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  51.53 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  47.23 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  47.9 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.38 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  49.78 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 687 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.74 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>