More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  82.63 
 
 
260 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  75.38 
 
 
264 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  71.04 
 
 
265 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  72.69 
 
 
261 aa  384  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  70.31 
 
 
265 aa  358  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  65.89 
 
 
264 aa  358  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  69.29 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  67.44 
 
 
261 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  68.11 
 
 
260 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  62.5 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  64.98 
 
 
261 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  62.89 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  64.86 
 
 
263 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  66.41 
 
 
261 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  64.45 
 
 
261 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  64.09 
 
 
261 aa  331  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  64.86 
 
 
263 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  64.09 
 
 
258 aa  329  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  63.95 
 
 
261 aa  328  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
260 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 
263 aa  324  8.000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  63.14 
 
 
687 aa  323  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  61.72 
 
 
262 aa  317  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  59.12 
 
 
287 aa  316  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  62.93 
 
 
261 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  59.53 
 
 
260 aa  315  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  62.16 
 
 
261 aa  314  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  63.95 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  63.71 
 
 
263 aa  311  6.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  61.78 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  61.78 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  61.78 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  60.32 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  59.62 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  59.77 
 
 
308 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  54.65 
 
 
267 aa  291  9e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  52.11 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  51.97 
 
 
248 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.55 
 
 
250 aa  245  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  52.36 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
248 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
248 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.98 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 
256 aa  237  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
251 aa  235  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.61 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
250 aa  231  6e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
254 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 
253 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
255 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
248 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 
251 aa  229  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
251 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.66 
 
 
650 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 
250 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  48.24 
 
 
252 aa  221  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
248 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 
256 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.24 
 
 
254 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
251 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
249 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  47.9 
 
 
243 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 
250 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  47.48 
 
 
243 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 
253 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 
250 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.1 
 
 
655 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.64 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.14 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.71 
 
 
646 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
251 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
251 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 
275 aa  209  3e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
251 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 
251 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.03 
 
 
654 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>