More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1258 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  82.63 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  73.75 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  69.11 
 
 		 265 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  69.8 
 
 		 261 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  68.87 
 
 		 265 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  64.73 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  66.8 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  65.35 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  62.16 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  63.64 
 
 		 261 aa  317  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  62.26 
 
 		 687 aa  316  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  63.04 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 271 aa  313  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  59.61 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  59.61 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  62.06 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  61.35 
 
 		 261 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  59.52 
 
 		 260 aa  304  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  60.63 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  61.33 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  58.2 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  61.15 
 
 		 263 aa  297  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  58.98 
 
 		 263 aa  295  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  56.04 
 
 		 287 aa  294  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  59.52 
 
 		 261 aa  292  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  60.32 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 270 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  57.25 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  51.76 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  53.12 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.55 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.63 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  42.58 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 254 aa  222  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 650 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.92 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 654 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  44.11 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  45.21 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  41.9 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 655 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>