More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0742 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  513  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  80.4 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  81.67 
 
 		 251 aa  407  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 250 aa  271  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.66 
 
 		 249 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.26 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 650 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 654 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 655 aa  239  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.95 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.95 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.27 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  49.18 
 
 		 298 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 263 aa  224  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 646 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  48.55 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.38 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  42.62 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0915  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  41.97 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>