More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2989 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  73.6 
 
 		 250 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  66.13 
 
 		 251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  66.53 
 
 		 257 aa  331  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  60.74 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  61.38 
 
 		 251 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  57.37 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  57.66 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  56.35 
 
 		 250 aa  284  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  58.47 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  57.83 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  54.98 
 
 		 251 aa  278  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 646 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  53.66 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  54.47 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  54 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  55.69 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 		 256 aa  267  8.999999999999999e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.51 
 
 		 650 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  55.78 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  57.21 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  55.69 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 654 aa  262  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  56.77 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 252 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 251 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.02 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 655 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 253 aa  251  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 298 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 275 aa  238  5e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  53.25 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  50.82 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>