More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1380 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  74.69 
 
 		 298 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  74.69 
 
 		 241 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  73.44 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  72.2 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  74.35 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  73.91 
 
 		 230 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  71.3 
 
 		 231 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  56.02 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  56.43 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  55.19 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  53.75 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  53.53 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  52.28 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  54.1 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 650 aa  248  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  52.61 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 646 aa  231  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 251 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 655 aa  222  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 654 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.36 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 260 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  48.55 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>