More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0799 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  87.75 
 
 
253 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
253 aa  329  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  328  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  328  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  63.28 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
251 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 
251 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  57.87 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  58.89 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  58.1 
 
 
252 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 
252 aa  295  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  56 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
248 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
248 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  57.14 
 
 
646 aa  275  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  52.99 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 
248 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
250 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
249 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
254 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
249 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.84 
 
 
255 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 
251 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.8 
 
 
250 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
251 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
248 aa  251  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.4 
 
 
257 aa  249  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  51.59 
 
 
255 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
254 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  50.84 
 
 
243 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
251 aa  244  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 
250 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 
256 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.42 
 
 
243 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
256 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
650 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 
252 aa  239  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
251 aa  238  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
251 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.18 
 
 
655 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
251 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
256 aa  235  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.79 
 
 
654 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.19 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
253 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
251 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  44.71 
 
 
265 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 
253 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 
248 aa  226  3e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 
255 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  46.85 
 
 
254 aa  225  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 
261 aa  225  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 
256 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
253 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 
241 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 
257 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0171  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 
256 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
257 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 
253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
264 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 
248 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 
263 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 
246 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
260 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
261 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
254 aa  222  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
246 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
241 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
251 aa  221  9e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
241 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 
243 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
250 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 
241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 
298 aa  218  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
253 aa  218  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
251 aa  217  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 
250 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>