More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2059 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  281  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.67 
 
 		 655 aa  270  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  53.01 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  55.87 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  53.95 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 654 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  53.51 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.82 
 
 		 249 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  52.19 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.82 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 646 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  49.12 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  48.24 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 249 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  46.51 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 650 aa  224  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  45.74 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 687 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>