More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0984 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  62.25 
 
 		 250 aa  329  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  62 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  65.2 
 
 		 249 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  63.16 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  68.92 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  62.8 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 		 256 aa  294  7e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  57.54 
 
 		 256 aa  294  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  60.48 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  55.95 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  54.05 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  56.75 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  53.67 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  63.71 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 250 aa  284  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  54.05 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  59.36 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  61.33 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  57.55 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  62.18 
 
 		 251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  62.18 
 
 		 251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  59.27 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 250 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  56.33 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  56.33 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  56.33 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  55.92 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  56.57 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  58 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  54.1 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  53.57 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  58.1 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  58.23 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  52.61 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  53.36 
 
 		 251 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  57.94 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 		 247 aa  254  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.18 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  52.53 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>