More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  65.22 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  65.76 
 
 		 261 aa  334  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  64.68 
 
 		 260 aa  331  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  64.09 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  63.71 
 
 		 264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  64.17 
 
 		 258 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  61.63 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  61.39 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  62.16 
 
 		 260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  60.24 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  62.55 
 
 		 265 aa  315  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.51 
 
 		 687 aa  315  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  59.77 
 
 		 261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  59.53 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  59.14 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  57.94 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  58.82 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  57.6 
 
 		 260 aa  294  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  56.47 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  55.16 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  57.59 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  60 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  56.18 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  59.36 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 261 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  58.2 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 650 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 646 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 654 aa  215  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 249 aa  212  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  48.24 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>