More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  61.92 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  63.81 
 
 		 264 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  60.62 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 		 264 aa  324  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  65.37 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 271 aa  318  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  61.57 
 
 		 265 aa  317  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  60.94 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  58.53 
 
 		 271 aa  315  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  60.56 
 
 		 261 aa  312  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  60.56 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  59.61 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  60.31 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  59.14 
 
 		 258 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  59.53 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.24 
 
 		 687 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  59.45 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  59.36 
 
 		 261 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  61.57 
 
 		 308 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  60.85 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  60.94 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  58.98 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 261 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  58.27 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  57.59 
 
 		 258 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  58.57 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  53.12 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  51.33 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.16 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51.18 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44.05 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.02 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.42 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  51.57 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.55 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 655 aa  220  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.38 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  42.41 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.63 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  49.03 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  45.85 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>