More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2089 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  88.93 
 
 		 271 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  64.59 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  64.31 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  67.06 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  62.99 
 
 		 261 aa  338  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  62.89 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.74 
 
 		 687 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  61.48 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  63.04 
 
 		 265 aa  331  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  61.81 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  60.63 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  59.29 
 
 		 260 aa  321  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  57.85 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 270 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  60.62 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  61.18 
 
 		 263 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  58.75 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  57.56 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  58.75 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  58.89 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  58.82 
 
 		 258 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  56.2 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  59.29 
 
 		 308 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  50.79 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  46.9 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  40.62 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.31 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.92 
 
 		 250 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.36 
 
 		 252 aa  208  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  41.34 
 
 		 252 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 257 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.13 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 275 aa  204  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 655 aa  202  6e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 250 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 251 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 251 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  43.24 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.62 
 
 		 646 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.06 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.09 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  37.94 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.3 
 
 		 650 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  43.92 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  46.48 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>