More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2065 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  84.94 
 
 		 308 aa  440  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  63.92 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  65.1 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  63.75 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  63.24 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  66.26 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  66.26 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  66.26 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  67.48 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  64.31 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  64.63 
 
 		 261 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  63.92 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  65.85 
 
 		 261 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 		 261 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  63.53 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  62.25 
 
 		 260 aa  329  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  65.04 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  61.9 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  64.03 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 262 aa  324  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  62.11 
 
 		 687 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  57.8 
 
 		 287 aa  318  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  60.08 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  61.57 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  59.62 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  61.96 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  55.34 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  49.01 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.84 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50.38 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 650 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 646 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>