More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5608 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  67.06 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  58.96 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  54.81 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  44.05 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  51.56 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 646 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 655 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 650 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 		 249 aa  221  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44.31 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.46 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  43.63 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  43.24 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  45.06 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  214  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  43.63 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>