More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0819 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  87.3 
 
 		 252 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  52.17 
 
 		 245 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  51.38 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 		 251 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  46.48 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  46.88 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.48 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  41.25 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  43.92 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  40.86 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  40.47 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 655 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  39.3 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 242 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  39.69 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 687 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>