More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2064 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  90.32 
 
 		 248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  89.52 
 
 		 248 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  80.82 
 
 		 245 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  80.82 
 
 		 245 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  64.52 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  64.52 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  64.52 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  64.52 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  64.11 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 266 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 251 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  65.32 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  61.2 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  65.32 
 
 		 248 aa  295  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  65.31 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  65.31 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  58.47 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  61.38 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 250 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  61.04 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  55.19 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  58.44 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  55.1 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  53.09 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  56.17 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  56.17 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  57.44 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.69 
 
 		 249 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  58.2 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 255 aa  241  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  54.01 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  51.81 
 
 		 256 aa  234  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  51.91 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 254 aa  224  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  53.17 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>