More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2815 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  76.49 
 
 
250 aa  364  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  79.84 
 
 
251 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  73.9 
 
 
247 aa  358  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  75.7 
 
 
250 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  73.23 
 
 
261 aa  334  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  73.79 
 
 
248 aa  318  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  69.42 
 
 
242 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3258  triosephosphate isomerase  72.02 
 
 
245 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  61.75 
 
 
248 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  62.06 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 
248 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 
248 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 
251 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 
251 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 
251 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  59.35 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
251 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
251 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  57.77 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 
245 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  57.71 
 
 
259 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  58.1 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  56.3 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  53.75 
 
 
253 aa  258  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 
253 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
259 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
249 aa  254  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 
249 aa  254  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 
250 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  56.69 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
251 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 
246 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 
245 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  58 
 
 
248 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  50.19 
 
 
256 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 
250 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
255 aa  238  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 
251 aa  234  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  51.64 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 
260 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  232  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 
251 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 
251 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 
250 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
256 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
252 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
253 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
255 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
255 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
255 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 
255 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 
249 aa  228  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 
260 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 
260 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 
260 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 
260 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.31 
 
 
650 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
250 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  49.59 
 
 
252 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>