More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1058 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  100 
 
 
251 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  90.44 
 
 
266 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  91.24 
 
 
266 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  91.24 
 
 
266 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  91.24 
 
 
251 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  90.84 
 
 
251 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  91.24 
 
 
266 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  91.24 
 
 
266 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  84.06 
 
 
251 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  83.67 
 
 
251 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  84.46 
 
 
251 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  83.67 
 
 
251 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  84.46 
 
 
251 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
251 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  83.67 
 
 
251 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  73.49 
 
 
259 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  74.21 
 
 
259 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  73.81 
 
 
258 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  66.94 
 
 
248 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 
248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  65.73 
 
 
248 aa  314  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  64.49 
 
 
245 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  64.08 
 
 
245 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  61.9 
 
 
251 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  59.29 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  61.85 
 
 
248 aa  265  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
250 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  60.24 
 
 
250 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 
250 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
250 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 
253 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 
246 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  56.4 
 
 
249 aa  258  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  55.2 
 
 
253 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 
245 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
270 aa  254  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 
251 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  58.61 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  56 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  60.48 
 
 
261 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
252 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  56.54 
 
 
251 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  56.54 
 
 
251 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  53.91 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
256 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 
248 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
252 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  53.17 
 
 
272 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
250 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
248 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  50 
 
 
232 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 
246 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 
251 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
250 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  51 
 
 
271 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
249 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
250 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 
254 aa  228  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
255 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
255 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 
249 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
253 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  47.29 
 
 
256 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  54.2 
 
 
255 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
255 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 
249 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 
255 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 
255 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  49 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.13 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 
254 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 
254 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 
256 aa  218  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.34 
 
 
250 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
260 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 
255 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
253 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 
260 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>