More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0870 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  98 
 
 		 250 aa  487  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  81.85 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  76.49 
 
 		 270 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  76.33 
 
 		 247 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  80.97 
 
 		 248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  75.4 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  65.2 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  70 
 
 		 242 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  64.78 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3258  triosephosphate isomerase  72.13 
 
 		 245 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  63.11 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  61.38 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  61.07 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  60.4 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 251 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  61.6 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  59.44 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  56.57 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  57.83 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  56.63 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  51.82 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  53.47 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  54.77 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  53.06 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 249 aa  244  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  51.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  53.11 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  52.05 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  54.85 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  55.88 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  55.88 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  54.47 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>