More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1885 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  55.02 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  53.2 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  51.57 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  48.03 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 654 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  48.84 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.5 
 
 		 655 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  51.8 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  46.01 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  46.01 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  46.32 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.45 
 
 		 243 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 646 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>