More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1464 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  74.6 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  71.89 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  70.56 
 
 		 252 aa  362  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  70.16 
 
 		 252 aa  347  9e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  67.34 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 		 249 aa  337  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  57.26 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  54 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  53.01 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56.22 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  54.66 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 654 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 646 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 655 aa  252  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 650 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  53.6 
 
 		 253 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51.81 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  48.18 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  48.91 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  51.95 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  48.92 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  49.39 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  51.46 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  51.46 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 252 aa  222  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 253 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>