More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0562 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  54.4 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  51.61 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.39 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50 
 
 		 650 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 654 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 265 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50 
 
 		 655 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  49.02 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  51.48 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.57 
 
 		 646 aa  230  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  49.58 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 687 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 298 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  47.93 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  45.91 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.77 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  49.16 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>