More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0875 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 
251 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
254 aa  278  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
655 aa  276  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 
254 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 
248 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 
248 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.42 
 
 
650 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 
251 aa  262  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  55.95 
 
 
243 aa  259  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
250 aa  259  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
252 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  56.83 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
250 aa  258  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 
252 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
251 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  51 
 
 
253 aa  253  3e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.43 
 
 
646 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50 
 
 
250 aa  251  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 
250 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
654 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49 
 
 
251 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 
257 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
251 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
250 aa  248  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 
250 aa  248  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
255 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
250 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 
249 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 
251 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
253 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
248 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  47.18 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  244  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.19 
 
 
250 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.81 
 
 
256 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  51.54 
 
 
243 aa  242  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
252 aa  238  8e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 
249 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
257 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  47.56 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
257 aa  235  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
248 aa  235  7e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 
253 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  48.4 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 
265 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 
253 aa  230  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  50.22 
 
 
240 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
253 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.77 
 
 
249 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
253 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 
256 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 
261 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 
261 aa  228  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
258 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 
251 aa  227  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
260 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
249 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
258 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 
251 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 
250 aa  225  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 
250 aa  224  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 
251 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.2 
 
 
253 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 
256 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.7 
 
 
687 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
253 aa  221  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
265 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 
250 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.63 
 
 
251 aa  221  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48.02 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44.84 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 
252 aa  219  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 
253 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
255 aa  219  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
253 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
253 aa  218  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
255 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 
249 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>