More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1026 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  100 
 
 
251 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  95.62 
 
 
251 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  94.42 
 
 
251 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  94.02 
 
 
251 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  94.02 
 
 
251 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  94.42 
 
 
251 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  94.02 
 
 
251 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  82.47 
 
 
266 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  83.67 
 
 
251 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  82.87 
 
 
251 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  83.27 
 
 
266 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  75.79 
 
 
259 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  75.79 
 
 
258 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  73.09 
 
 
259 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  67.74 
 
 
248 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  69.35 
 
 
248 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  67.35 
 
 
245 aa  317  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  66.94 
 
 
248 aa  315  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 
245 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  58.4 
 
 
253 aa  288  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  63.89 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  59.52 
 
 
248 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  60 
 
 
249 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  57.2 
 
 
253 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 
246 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  60.8 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
250 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 
250 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  60.8 
 
 
250 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 
248 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 
270 aa  261  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  60.8 
 
 
261 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
250 aa  259  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  53.36 
 
 
253 aa  259  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  56.38 
 
 
251 aa  256  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  59.02 
 
 
247 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
245 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  53.57 
 
 
252 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  54.69 
 
 
251 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 
272 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  60.24 
 
 
251 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 
256 aa  248  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  52 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  54.65 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
249 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0819  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
253 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
252 aa  237  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 
255 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
254 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
249 aa  235  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  50 
 
 
246 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
249 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 
251 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
253 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
255 aa  230  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 
271 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 
252 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 
254 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 
255 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  49 
 
 
250 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 
248 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
255 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 
249 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 
249 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 
250 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  49.15 
 
 
232 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
256 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 
255 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
250 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 
257 aa  225  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50 
 
 
250 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  50 
 
 
256 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 
248 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 
250 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  54.85 
 
 
255 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  51.78 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
253 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
253 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.1 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  49 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  50.62 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
255 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
255 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 
255 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>