More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1835 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  86.4 
 
 		 250 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  74.7 
 
 		 257 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  72.29 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  70.97 
 
 		 261 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  70.61 
 
 		 251 aa  357  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  69.35 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  67.2 
 
 		 250 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  68.67 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  68.27 
 
 		 245 aa  330  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  67.21 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  67.61 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  66.8 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  63.41 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  63.41 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  63.82 
 
 		 256 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  63.41 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  63.41 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  63.27 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  63.37 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  61.29 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  57.09 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  61.13 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  61.13 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  62.18 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  60 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  61.81 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  60.49 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  62.65 
 
 		 254 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  61.29 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  58.55 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  58.06 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  57.37 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  51.22 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  59.27 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  56.1 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 249 aa  231  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  55.6 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 249 aa  214  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 245 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>