More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2350 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  62.96 
 
 		 250 aa  284  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  65.43 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  63.22 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  60.73 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  58.96 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  60.4 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  59.27 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  58.7 
 
 		 245 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 		 251 aa  267  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  59.76 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  59.5 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 250 aa  265  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  59.04 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  59.18 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  61.57 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  56.38 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  55.92 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 248 aa  248  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  58.06 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  56.84 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  56.79 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  55.97 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  55.33 
 
 		 254 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  54.1 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  54.1 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  54.73 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  55.37 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  53.28 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  56.13 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  57.02 
 
 		 262 aa  234  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  48.97 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  58.26 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  62.45 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  51.84 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  53.06 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  50.78 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.9 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  51.05 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  48.47 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.24 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>