More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1405 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  57.2 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  56.85 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  56.79 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  56.1 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  60.49 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  56.79 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  57.38 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  57.09 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  55.36 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  57.14 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  55.06 
 
 		 254 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  54.1 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  56 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  53.06 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  55.24 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  55.24 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  55.37 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  56.56 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  57.83 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  62.1 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  59.11 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.28 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  53.72 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  52.65 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  52.46 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  54.88 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.04 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  47.33 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  46.5 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.72 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  47.54 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>