More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0598 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  99.18 
 
 		 245 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  90.61 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  75.82 
 
 		 247 aa  359  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  68.67 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  70.33 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  65.86 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  65.31 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  67.07 
 
 		 250 aa  311  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  62.86 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  63.27 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  62.6 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  67.62 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  62.75 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 254 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 254 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  60.66 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  61.13 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  61.25 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  56.25 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  55.65 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  56.68 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  56.41 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  58.61 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  55.92 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  55.92 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  57.38 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  55.1 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  56.52 
 
 		 253 aa  241  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  53.06 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.01 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.98 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  52.52 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  52.46 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  48.16 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.4 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.75 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.74 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  48.96 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.54 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>