More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2031 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  95.7 
 
 		 256 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  82.03 
 
 		 256 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  78.52 
 
 		 256 aa  417  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  63.82 
 
 		 250 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  61.02 
 
 		 254 aa  321  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  62.55 
 
 		 250 aa  314  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  61.66 
 
 		 257 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  61.04 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  59.51 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  57.48 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 251 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 254 aa  294  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 254 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  57.14 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  59.35 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  58.94 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  61.85 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  59.04 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  57.66 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  55.73 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  56.07 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  59.04 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  53.63 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  54.88 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  53.25 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  51.6 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  55.97 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  48.22 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.47 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  47.1 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  41.6 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.9 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 687 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>