More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1636 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  62.75 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  62.35 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  61.51 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  63.56 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  61.54 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 		 256 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  62.3 
 
 		 256 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  62.65 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  61.63 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  62.45 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  60.57 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  62.45 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  60.64 
 
 		 251 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  58.73 
 
 		 257 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  59.13 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  58.66 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  61.25 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  57.09 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  57.96 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  54.66 
 
 		 254 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  53.04 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  56.49 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  57.77 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  54.44 
 
 		 254 aa  255  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  54.44 
 
 		 254 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  55.24 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  55.06 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  52.59 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  54.92 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 248 aa  204  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.39 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  45.85 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  47.54 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.68 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  47.13 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  45.04 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>