More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0764 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  66.53 
 
 		 248 aa  324  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  68.16 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  68.57 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  66.94 
 
 		 245 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  66.53 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  64.8 
 
 		 250 aa  311  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  63.6 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  63.6 
 
 		 254 aa  296  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  63.6 
 
 		 254 aa  296  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  66.26 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  59.84 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  61.63 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  60.89 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  59.44 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  61.94 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  58.68 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  58.58 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  58.94 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  57.66 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  58.16 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 254 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  57.89 
 
 		 253 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  56.07 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  58.2 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  56.07 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  56.07 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  60.4 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  54.08 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  53.6 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  59.18 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  57.38 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  54.73 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  44.53 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  48.57 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.18 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  45.87 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 275 aa  191  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.4 
 
 		 655 aa  191  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  45.85 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>